Bệnh viện Trung ương Giả có 68 khoa, phòng, trung tâm tại hai cơ sở, được tổ chức thành bốn khối: khối lâm sàng (30 khoa), khối cận lâm sàng (10 khoa), khối phòng chức năng (12 phòng), các trung tâm (8 trung tâm), cùng 8 khoa, phòng tại Cơ sở 2 Giả Phong. Mỗi trang dưới đây liệt kê tên đơn vị, vị trí và lĩnh vực hoạt động chính.
Sơ đồ khuôn viên cơ sở chính
| Khu nhà | Đơn vị chính |
|---|---|
| Nhà A (hành chính, 5 tầng) | Ban Giám đốc, các phòng chức năng, Hội trường A (tầng 3), Phòng tiếp công dân (tầng 1) |
| Khoa Khám bệnh (3 tầng, cạnh cổng chính) | Tiếp đón, phòng khám BHYT, Nhà thuốc số 1, Phòng tiêm chủng dịch vụ, quầy Công tác xã hội |
| Tòa nhà Kỹ thuật cao (12 tầng) | Khoa Khám bệnh theo yêu cầu (tầng 2), Chẩn đoán hình ảnh (tầng 1), khu phẫu thuật và phòng mổ Hybrid (tầng 4–5), khu điều trị theo yêu cầu (tầng 8–11), Trung tâm Đào tạo – Chỉ đạo tuyến (tầng 1) |
| Nhà B (9 tầng) | Các khoa Nội |
| Nhà C (7 tầng) | Các khoa Ngoại, Răng Hàm Mặt, Mắt, Tai Mũi Họng |
| Nhà D (8 tầng) | Trung tâm Tim mạch, Trung tâm Đột quỵ, Hồi sức tích cực, ký túc xá học viên (tầng 8) |
| Nhà E (6 tầng) | Sản, Nhi, Sơ sinh |
| Nhà F (5 tầng) | Trung tâm Ung bướu, Y học hạt nhân, xạ trị |
| Nhà G | Khoa Cấp cứu (tầng 1, lối vào riêng từ đường Nguyễn Du), Khoa Thận nhân tạo, Khoa Bệnh nhiệt đới |